叶绿素传感器以多种形式存在于浮游植物及蓝绿藻等光合生物中。水样中浮游生物的浓度就是通过测量其中的叶绿素含量来确定的。该测量方法对于生态系统的“健康”有重要意义。测量也可以用以确认藻华及其对水质的影响，并预测出有害赤潮的发生。